東京のシステム開発会社おすすめ20選｜中小企業向け・費用相場・選び方【2026年最新版】

東京には、業務システム、Webシステム、スマートフォンアプリ、AI、基幹システムなどに対応するシステム開発会社が数多くあります。しかし、会社によって得意分野や対応できる開発規模、契約形態、保守体制は大きく異なります。

特に中小企業がシステム開発を外注する場合は、知名度や会社規模だけで選ぶのではなく、自社の業務を理解して提案してくれるか、開発後の改善や保守まで相談できるかを確認することが重要です。

本記事では、東京に本社または営業拠点を持つシステム開発会社を、中小企業向け、AI・アプリ開発、業務システム、基幹・大規模開発の4つに分けて紹介します。費用相場や見積もりの比較方法、失敗しない選び方も解説しますので、東京でシステム開発会社を探している方は参考にしてください。

なお、掲載順は優劣を示すランキングではありません。会社情報は2026年8月時点の公式情報をもとに整理しており、最新情報や個別の料金については各社へ直接ご確認ください。

東京のシステム開発会社おすすめ20社の比較早見表

はじめに、今回紹介する東京のシステム開発会社20社を一覧で比較します。ほとんどのシステム開発は個別見積もりとなるため、料金だけでなく、得意領域と自社の開発目的が合っているかを確認しましょう。

東京で中小企業におすすめのシステム開発会社5選

中小企業がシステム開発会社を選ぶ際は、予算規模だけでなく、業務内容を整理する段階から相談できるかが重要です。ここでは、業務システムやWebシステムの受託開発に対応し、比較的小回りの利く提案が期待できる会社を紹介します。

企画から開発・保守まで相談できる「株式会社ファーストネットジャパン」

株式会社ファーストネットジャパンは、大阪本社と東京オフィスを拠点に、業務システム、Webシステム、スマートフォンアプリ、ECシステム、AIを活用したシステムなどを開発しています。

「何を作れば課題を解決できるのか分からない」という企画段階から相談でき、要件整理、設計、デザイン、開発、テスト、公開後の保守まで一貫して対応できる点が特徴です。既存システムの改修、API連携、データ移行、他社が開発したシステムの保守引き継ぎにも対応しています。

また、Web制作やWebマーケティングも社内で対応しているため、顧客向けWebサービスやECサイトなど、集客とシステムの両方が必要なプロジェクトにも適しています。東京で中小企業向けのシステム開発会社を探している場合は、まず現在の業務や課題から相談できます。

• 1998年創業、累計4,000件を超える制作・開発実績
• 業務システム、Webシステム、アプリ、AI、既存改修に対応
• 要件整理から開発後の保守・改善まで一貫して相談可能

ファーストネットジャパンのシステム開発サービスを見る

受託開発とITアウトソーシングに対応する「メディアファイブ株式会社」

メディアファイブ株式会社は、システム受託開発、SES、ITアウトソーシング、IT人材育成などを展開しています。東京支店は秋葉原にあり、首都圏の企業にも対応しています。

システムを新規開発するだけでなく、IT担当者の不足、既存システムの運用、社内IT環境の整備などをまとめて相談したい企業に向いています。

Web業務システムの開発に強い「メディアボックス株式会社」

メディアボックス株式会社は、PHPやLaravelを用いたWebシステム開発を中心に、業務システム、ECサイト、マッチングサイト、会員サイトなどを手掛けています。

Excelや手作業で管理している業務をWebシステムへ移行したい企業や、既存のWebサービスをリニューアルしたい企業に適しています。開発後の運用保守やIT顧問にも対応しています。

中小企業の業務効率化を支援する「株式会社ユーネット」

株式会社ユーネットは、受発注システム、宿泊システム、生産管理システムなど、企業ごとに異なる業務課題に対応するシステム開発会社です。

新規開発だけでなく、既存システムやオープンソースを活用した提案にも対応しています。予算や納期に合わせて現実的な開発方法を検討したい中小企業に向いています。

業務内容を理解した分かりやすい提案が特徴の「株式会社KITOHA」

株式会社KITOHAは、業務システム、Webシステム、スマートフォンアプリなどを開発しています。顧客の業務を理解したうえで、分かりやすく提案することを重視している会社です。

物流分野では荷物追跡システムを自社開発しており、受託開発に加えて業務運用を踏まえたシステム提案を求める企業に向いています。

AI・Web・アプリ開発に強い東京のシステム開発会社5選

AI、データ分析、スマートフォンアプリ、顧客向けWebサービスなどを開発する場合は、技術力だけでなく、事業への導入方法やユーザー体験まで提案できる会社を選ぶ必要があります。

AIのビジネス実装に強い「株式会社KICONIA WORKS」

株式会社KICONIA WORKSは、AIやデータ分析、画像認識、需要予測、自然言語処理などを、企業の業務やサービスへ実装する開発会社です。

AIモデルだけを開発するのではなく、システムや画面、インフラ、既存システムとのAPI連携まで含めた構築に対応しています。AIの活用方法が決まっていない企業でも、課題整理から相談できます。

企画・DX支援から開発まで対応する「株式会社GeNEE」

株式会社GeNEEは、業務システム、Webシステム、スマートフォンアプリ、AI、DX・ITコンサルティングなどを提供しています。

企画構想や要件定義から、UI・UX設計、開発、運用保守まで対応しているため、新規サービスやDXプロジェクトを一括で依頼したい企業に適しています。

AI・IoT・アプリまで幅広く対応する「株式会社アイエンター」

株式会社アイエンターは、Webシステム、業務システム、スマートフォンアプリ、IoT、AI、XR、クラウド、RPAなど幅広い技術領域に対応しています。

UX設計やデザインにも対応しているため、業務効率化だけでなく、利用者の操作性や顧客体験も重視したい企業に向いています。

顧客向けアプリや会員サービスに強い「株式会社クロス・コミュニケーション」

株式会社クロス・コミュニケーションは、スマートフォンアプリやWebシステムの企画、開発、運用を手掛けています。

金融、会員サービス、予約、クーポン、LINEミニアプリなど、顧客との接点となるデジタルサービスの開発実績があります。マーケティングリサーチやデータ分析まで含めて相談できる点も特徴です。

デジタル変革をグローバルに支援する「株式会社モンスターラボ」

株式会社モンスターラボは、デジタル戦略、サービス設計、システム・アプリ開発、AI、データ活用、既存システムのモダナイゼーションなどを支援しています。

国内外の開発拠点や専門人材を活用し、大規模なデジタルサービスやグローバル展開を前提としたプロジェクトにも対応しています。

業務システム・特定業種に強い東京のシステム開発会社5選

販売管理、受発注、在庫、物流、不動産、教育、小売、金融などのシステムは、プログラミング技術だけでなく、業務への理解が重要です。ここでは、業務システムや特定業種に強みを持つ会社を紹介します。

開発人材とシステム構築を支援する「株式会社アクロネット」

株式会社アクロネットは、システム開発、システムインテグレーション、SES、Web制作、ソリューション販売などを手掛けています。

Web系、組込み系、インフラ、ネットワークなど幅広い領域の技術者が在籍しており、開発チームやエンジニアを補強したい企業に向いています。

物流システムと現場DXに強い「アリスタソリューション株式会社」

アリスタソリューション株式会社は、物流システムインテグレーション、IT人材、DXソリューションの3事業を展開しています。

物流現場の業務分析、倉庫内のオペレーション改善、システム導入などを相談できます。物流業務の効率化や自動化を進めたい企業に適しています。

教育機関・不動産のWebシステムに強い「メディアマックスジャパン株式会社」

メディアマックスジャパン株式会社は、Webシステム開発、Webサイト制作、運用保守、Webマーケティングを提供しています。

大学などの教育機関、不動産管理、物件検索、在籍管理などの開発実績があり、Webサイトと業務システムを一体で構築したい企業や組織に向いています。

小売・卸売・金融業のシステムに強い「株式会社ユーエスエス」

株式会社ユーエスエスは、小売、卸売、金融業に特化した業務システムの開発、運用、保守を行っています。

店舗管理、受発注、販売、在庫、顧客管理、金融業務など、業界特有の業務を理解した開発を求める企業に適しています。グループ累計7,000店舗以上への導入実績を公表しています。

開発体制を柔軟に組める「株式会社FUSIONIA」

株式会社FUSIONIAは、IT人材支援やプロジェクトへのエンジニア参画、Webソリューションなどを提供しています。

チーム単位での参画からスポット対応まで相談できるため、社内の開発体制を補完したい企業や、プロジェクトごとに必要な技術者を確保したい企業に向いています。

大規模・基幹システム開発に対応する東京の会社5選

基幹システム、社会インフラ、組込みシステム、全国の拠点で利用するシステムなどは、開発体制、品質管理、セキュリティ、長期運用の実績が重要です。

幅広い開発領域を持つ「東京システム開発株式会社」

東京システム開発株式会社は、1987年設立のシステム開発会社です。幅広い開発領域で培った知識と、顧客に近い位置で進める開発体制を特徴としています。

業務システムから社会を支えるシステムまで対応しており、長期的な運用や保守を前提とした開発を依頼したい企業に向いています。

製造・流通・金融から組込みまで対応する「NSW株式会社」

NSW株式会社は、企業向けシステム、クラウド、製造・流通・金融分野のソリューション、組込みソフトウェア、半導体関連など幅広い事業を展開しています。

大規模システム、複数拠点への導入、インフラを含むシステム構築など、総合的な対応力を求める企業に向いています。

医療・車載・公共・金融に対応する「株式会社アイ・エス・ビー」

株式会社アイ・エス・ビーは、モバイル、医療、車載などの組込みソフトウェアに加え、官公庁、金融、通信、運輸向けのシステム開発を行っています。

品質管理やセキュリティ、業界固有の要件が求められるプロジェクトを依頼したい企業に適しています。

企画から運用まで総合的に支援する「株式会社システナ」

株式会社システナは、業務システム、Webサービス、スマートフォンアプリ、車載、社会インフラ、金融、AI、クラウド、ITサポートなど幅広いサービスを提供しています。

システムの企画・設計・開発だけでなく、インフラ、運用、ヘルプデスクまで含めた総合的な支援を求める企業に向いています。

情報連携・セキュリティ・遠隔監視に対応する「昭和システム開発株式会社」

昭和システム開発株式会社は、独立系の受託システム開発会社として、情報連携、セキュリティ、遠隔監視を中心としたソリューションを提供しています。

システム開発から保守までの一貫対応を掲げており、社会インフラや長期運用を前提としたシステムを検討している企業に向いています。

東京のシステム開発費用相場

システム開発の料金は、画面数、機能数、利用者数、権限、外部サービスとの連携、データ移行、セキュリティ要件などによって変わります。

東京の会社だから必ず高額になるわけではありませんが、人件費やプロジェクト管理費が見積もりへ反映されるため、地方や海外の開発会社より高くなる場合があります。

上記は一般的な目安です。同じ名称のシステムでも、必要な機能によって費用は数倍変わる場合があります。

システム開発費を左右する主な要素

• 画面数と機能数
• 利用者数とアクセス数
• 管理者・担当者・一般利用者などの権限数
• 決済、会計、CRM、基幹システムなどとの外部連携
• 既存データの整理と移行
• スマートフォンアプリの有無
• セキュリティや監査への対応
• マニュアル、研修、運用支援の範囲
• リリース後の保守・監視体制

東京でシステム開発会社を選ぶ7つのポイント

開発したいシステムと近い実績があるか

販売管理を作りたい場合は販売・在庫・受発注、顧客向けアプリを作りたい場合はアプリや会員サービスなど、自社の目的に近い実績があるかを確認します。

業界が同じでなくても、必要な機能や利用者、データ量、セキュリティ要件が近い実績があれば、開発を円滑に進めやすくなります。

要件が固まる前から相談できるか

初めてシステムを開発する企業では、必要な機能を完全に整理してから問い合わせる必要はありません。

現在の業務、困っていること、実現したい状態、予算、希望時期を伝えたうえで、必要な機能を一緒に整理してくれる会社を選びましょう。

見積もりの対象範囲が明確か

見積もり金額だけでなく、要件定義、デザイン、開発、テスト、データ移行、マニュアル、サーバー構築、保守など、どこまで含まれているかを確認します。

初期費用が安くても、後から追加費用が発生すると総額が高くなるため注意が必要です。

プロジェクトの管理方法を確認する

誰が窓口になるのか、進捗をどのように共有するのか、課題や仕様変更をどのように管理するのかを確認します。

定例会議、チャット、課題管理ツールなど、発注側も状況を把握できる体制がある会社を選びましょう。

開発後の保守・改善に対応できるか

システムは公開して終わりではありません。不具合への対応、OSやミドルウェアの更新、機能追加、業務変更への対応が必要です。

保守料金、対応時間、障害時の連絡方法、追加開発の進め方まで事前に確認しておくことが重要です。

セキュリティと品質管理の体制があるか

顧客情報、従業員情報、決済情報などを扱う場合は、アクセス権限、通信の暗号化、バックアップ、操作履歴、脆弱性対策などを確認します。

必要に応じて、ISMSやプライバシーマークの有無、テスト工程、レビュー体制についても確認しましょう。

担当者と継続的に意思疎通できるか

システム開発は、小規模でも数か月、大規模なものでは1年以上かかる場合があります。

専門用語を一方的に使わず、発注側の意図を確認しながら説明してくれる担当者かどうかも重要な選定基準です。

システム開発の相見積もりは3社程度が目安

システム開発を外注するときは、2〜4社、基本的には3社程度から提案と見積もりを取るのがおすすめです。

見積もり先が1社だけでは、料金や提案内容が妥当か判断しにくくなります。一方で、あまり多くの会社へ依頼すると、打ち合わせや質問への回答に時間がかかり、比較条件も揃いにくくなります。

各社へ同じ条件を伝えるため、次の内容を簡単に整理しておきましょう。

• 開発したいシステムの目的
• 現在の業務と課題
• 主な利用者
• 必要と思われる機能
• 既存システムやデータの有無
• 予算の上限または予算帯
• 希望する公開時期
• 開発後に依頼したい保守内容

見積もりの詳しい確認方法は、関連記事の「システム開発の見積もり内訳」も参考にしてください。

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よくある質問（FAQ）

東京でシステム開発を依頼する費用相場はいくらですか？

小規模な業務効率化ツールは100万〜300万円、中規模のWeb・業務システムは300万〜800万円、基幹システムや大規模開発は1,000万円以上が目安です。機能、連携、データ移行、セキュリティ要件によって金額は変わります。

中小企業はどのようなシステム開発会社を選ぶべきですか？

業務や課題を整理する段階から相談でき、予算に合わせて機能の優先順位を提案してくれる会社が適しています。公開後の保守や追加開発に対応できるかも確認しましょう。

システム開発の相見積もりは何社に依頼すればよいですか？

3社程度が目安です。複数社へ同じ条件を伝え、金額だけでなく、提案内容、開発範囲、保守体制、担当者とのコミュニケーションを比較してください。

システム開発にはどのくらいの期間がかかりますか？

小規模なシステムは3〜6か月、中規模では6〜12か月、大規模な基幹システムでは1年以上かかる場合があります。要件定義やデータ移行の内容によって期間は変わります。

東京以外のシステム開発会社へ依頼しても問題ありませんか？

オンライン会議やチャットを活用できる会社であれば、所在地にかかわらず依頼できます。対面打ち合わせの必要性、緊急時の対応方法、開発実績、保守体制を確認して選びましょう。

要件が決まっていなくてもシステム開発会社へ相談できますか？

相談できます。現在の業務、困っていること、実現したい状態、予算、希望時期を伝えることで、必要な機能や開発方法を整理してもらえます。

まとめ

東京には、中小企業向けの業務システムから、AI、スマートフォンアプリ、物流、金融、社会インフラ、大規模な基幹システムまで、さまざまな分野に対応するシステム開発会社があります。

会社を選ぶ際は、会社規模や料金だけでなく、自社と近い開発実績、要件整理の支援、プロジェクト管理、保守体制、担当者とのコミュニケーションを比較することが重要です。

株式会社ファーストネットジャパンでは、東京・大阪の2拠点で、業務システム、Webシステム、アプリ、AI、既存システムの改修、API連携、保守引き継ぎなどに対応しています。要件が固まっていない段階でも、現在の業務や課題からご相談いただけます。